实验室安全是实验室管理的一项重要工作，生物实验教学中心历来重视实验安全与环境问题。为了强化学生的安全意识和环保意识，加强实验室安全管理，保障实验者的人身安全和健康，保护国家财产不受损失，确保实验教学和科学研究在安全和环境友好的条件下进行，中心制定了一系列的环境与安全管理规章制度，实行了实验室安全与防护知识考试准入制度，考试不合格不能进入实验室参加实验等。要求所有进入实验室的人员都要自觉作好实验室的安全管理工作，牢固树立“安全第一”的观念，执行“谁主管、谁负责”和“谁使用、谁负责”的安全管理责任制。实验室安装配备了监控、消防应急自救设施（红外监控、报警器、喷淋器、洗眼器等），有效的保障了实验安全。对可能出现的突发安全事故，制定了“应急预案”。重视培养学生的环境保护意识，要求学生实验室不得随意排放废气、废液、废渣，对“三废”要妥善处理，将其放入回收瓶并标明类别、主要成分名称或分子式，然后送临时存放处集中处理。实验室专设安全员，负责对实验室的安全检查，坚持做好安全检查记录，发现安全隐患要及时整改。自实验中心成立以来，未发生任何安全事故。